De befaamde Memories Off-reeks keert terug. In een moderne setting, 10 jaar na de originele reeks, komt een aangrijpend verhaal over verdriet, vriendschap en mysterie.

Junya Mizumoto, een universiteitsstudent, rouwt om het verlies van zijn broer door een tragisch ongeval slechts een jaar eerder, wanneer hij een mysterieus meisje ontmoet dat hem vertelt dat hij degene had moeten zijn die stierf, voordat ze verdwijnt.

Met het gewicht van die angstaanjagende woorden en de herinneringen aan zijn broer draagt Junya een onverwacht project met zich mee met zijn jeugdvriendin, Chihaya Hojo. Het Hojo-landhuis, een traditioneel Japans huis, moet gerenoveerd worden en het is Junya's eerste grote klus om aan te nemen. Maar het is een klus die hij niet alleen kan uitvoeren.